公司长期零申报可能会存在以下风险：

1. 税务问题：长期零申报会导致企业没有纳税记录，无法提供相应的税收凭证和资料。这可能导致企业的税务申报不准确、漏报或错报等问题，从而增加企业的税务负担。此外，税务机关也会对长期未缴税的企业进行追缴，并处以罚款。

2. 公司信誉受损：长期零申报会使企业在公众眼中失去信用，影响其形象和声誉。如果公司长时间没有经营活动，可能被视为“空壳公司”或者被怀疑为逃避债务或逃税等违法行为。这将导致公司在市场竞争中处于不利地位，甚至被吊销营业执照或被列入黑名单。

3. 经济处罚：根据相关法律法规，企业必须按时缴纳各项费用和税款才能正常运营和发展。因此，长期零申报将面临经济处罚的风险。税务部门可能会采取各种措施来催缴欠税，如限制银行账户使用、冻结资产等，严重者可能会被追究刑事责任。同时，企业的信用评级也将受到影响，可能会影响其融资和贷款的便利性。

4. 企业发展受阻：长期零申报会使企业的发展停滞不前甚至倒退。由于缺乏收入来源和管理成本的增加，企业可能会陷入财务困境，难以维持正常的生产和经营活动。这不仅会影响员工的工作稳定性和企业的可持续发展，还可能引发企业破产或重组等重大事件发生。

综上所述，公司长期零申报可能会带来一系列的风险和不利影响：税务问题和信誉损失、经济处罚以及阻碍企业发展的后果。为了避免这些风险，建议企业及时申报纳税，保持良好的经营状况和财务管理能力；同时也应该遵守相关的法律法规，依法履行义务和责任。