商品流通许可证（简称流通证）是指为了规范商品的流通行为，而由国家相关部门颁发给营业者的一种经营许可制度。 持有流通证是开展商品交易活动的必要凭证，以下是详细的办理流程和收费标准。

一、办理流程

1. 表格填写：请下载并填写《商品流通许可申请表》，该表格包括申请人信息、企业信息、许可行为等内容。填好后打印并签字。

2. 提交申请材料：将填好的申请表和以下材料一同提交给当地的市场监管部门：

a) 有效的组织机构代码证、税务登记证、企业法人营业执照副本；

b) 计量认证证书、产品生产许可证、特种设备制造许可证等能够证明企业的生产、技术水平的相关资质证书；

c) 涉及食品、化妆品、医疗器械、保健品等的，还需要提供相应的生产许可证、卫生许可证等；

d) 环境评估报告及其他有关说明材料。

3. 审核验收：经过部门审核，如果材料齐全、符合要求，且行业市场监管部门认为此申请不会影响公共利益、社会稳定等方面的因素，则会核发《商品流通许可证》。

二、收费标准

根据《物品流通管理条例》和《收费公式管理办法》的规定，不同行业的流通证收费情况并不一致。以南京市为例，以下是该地区不同行业申请流通证的收费标准：

1. 食品类

指导价(元/件) 1000元

最高价（元/件）2000元

2. 医疗器械类

指导价（元/件）3000元

最高价（元/件）6000元

3. 保健品类

指导价（元/种）6000元

最高价（元/种）12000元

4. 化妆品类

指导价（元/件）10000元

最高价（元/件）20000元

总之，不同地区和行业的流通证收费标准会有所不同，具体收费情况，需要依据具体地区及上述相关制度与政策来实际操作。